对于这些超大件装备，虽然难以装入单个集装箱里，但如果采取“箱货分离”模式，将框架集装箱或平台集装箱和装备先后分别装到集装箱船上，利用两个或两个以上的集装箱载运能力，或亦可利用集装箱船进行运输。所谓“箱货分离”模式，也称分体吊装模式，就是指摆脱传统的先将装备装箱绑扎，然后再一体装船的操作方式。而是，先将适当数量的空框架集装箱或平台集装箱等装上船舶相应的舱位，形成一个大的装载平台，再将超大件装备吊装上船，放至大的装载平台上的相应位置，将装备和框架集装箱或平台集装箱进行绑扎加固在船上。在卸船时，与此顺序相反。采取此种运输组织模式，装备尺寸、重量不拘泥于单个集装箱的尺寸和载重量限制，更具灵活性，能够较好地满足批量小、时限要求紧的大型特种装备运输需求。
1. 普通集装箱又称做干货集装箱：是一种较为常见也是相对普遍的集装箱，这种集装箱占有所有集装箱的百分之七十到百分之八十左右，主要以运输杂物为主，如五金，工艺品，日用百货等。
2.冷冻集装箱一般分为两种，分别为内置于外置，内置温度一般在-28度和+26度之间，可以随时启动冷冻机，而外置式本身没有冷冻机，需要外部设施进行制冷.
3.开顶集装箱没有箱顶，可使用起重机从箱顶上面直接装卸货物。一般适合装载体积高大的物体，如玻璃板等。
4.框架集装箱则没有箱顶和两侧，可以直接从集装箱侧面进行装卸。以超重货物为主要运载对象，诸如钢材之类可以免除外包装的裸装货。
5.牲畜集装箱：转为牲畜而制作的一种集装箱，可以喂食，有通风孔保证空气。
6.通风集装箱：箱壁有通风孔，内壁涂塑料层，适宜装新鲜蔬菜和水果等怕热怕闷的货物。
随着集装箱运输的发展，为适应装载不同种类货物的需要，因而出现了不同种类的集装箱。这些集装箱不仅外观不同，而且结构、强度、尺寸等也不相同。根据集装箱的用途不同分有以下几种。
罐式集装箱（Tank Container）
这是一种供装运液体货而设置的集装箱，如酒类、油类及液状化工品等货物。它由罐体和箱体框架两部分组成，装货时货物由罐顶部装货孔进入，卸货时，则由排货孔流出或从顶部装货孔吸出。
汽车集装箱（Car Container）
这是专为装运小型轿车而设计制造的集装箱。其结构特点是无侧壁，仅设有框架和箱底，可装载一层或两层小轿车。
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